組織

総務部

総務課 総会・理事会の開催、定款・諸規程の管理、人事・給与・服務に関すること、文書の収受、事務所管理及び職員の福利厚生等
会計課 予算、決算、経理全般、監事会の開催等

企画部

企画調査課 社会保障制度に関する総合的調査研究・企画立案、国保その他社会保険に関する調査研究、資料収集、作成等
事業・研修課 国保制度改善強化に関すること、都道府県間の診療報酬全国決済業務(後期高齢者医療を含む)、超高額医療費共同事業の実施(後期高齢者医療に係る特別高額医療費共同事業を含む)に関すること、国保連合会職員及び国保関係者の研修の企画立案及び研修会の実施等

保健事業部

保健事業課 保健事業の企画・調査・研究、国保連合会における保健事業の指導・支援、国保保険者(市町村)の保健事業の支援、特定健診・特定保健指導に関すること等
保健情報管理課 特定健診等データ管理システム/国保データベースシステムの研究、開発及び維持管理、保険者(市町村)及び国保連合会における国保データベースシステム活用等の支援に関すること

医療保険部

国保総合システム管理課 国保総合システムの研究、開発及び維持管理に関すること、国保中央会、国保連合会、保険者間のネットワークに関すること、他の部に属さない電算システムに関すること等
国保総合システム開発課 次期国保総合システムの研究、開発及び維持管理に関すること
後期高齢者医療システム課 後期高齢者医療広域連合電算処理システムの研究、開発及び維持管理に関すること
新国保保険者システム課 新国保保険者システムの研究、開発及び維持管理に関すること

介護保険部

介護保険課 介護報酬審査支払等システムの研究・開発及び維持管理、都道府県間の介護報酬全国決済業務、介護保険者事務共同事業、その他介護保険制度に関すること
障害者給付課 障害者総合支援給付支払等システムの研究・開発・維持管理、都道府県間の障害者総合支援給付費全国決済業務、障害者総合支援給付費共同受付業務、市町村等事務共同事業等

広報部

広報一課 機関紙「国保新聞」/「国保情報」の編集・発行、情報の収集整理、
国保連合会の広報活動の支援・その他広報宣伝に関すること
広報二課 各種出版物の企画・編集・発行等

審査部

審査企画課 診療報酬審査支払制度の研究、診療報酬審査支払業務の充実強化に関すること、審査事務共助知識力認定試験制度に関すること等
審査業務課 国保連合会に請求のあった診療報酬明細書のうち1件当たり月額が医科40万点、歯科20万点、漢方4千点以上のものについての特別審査、国保診療報酬特別審査委員会に関すること等(1点=10円)
システム統括本部 セキュリティポリシーの管理・運用、システム委員会の運営をはじめとする各種システムの一元的管理に関すること
番号制度対策本部 国民健康保険、後期高齢者医療、介護保険等保険者及び国保連合会の業務に係るマイナンバー制度に関する企画、連絡・調整等 マイナンバー制度における保険者等及び国保連合会の情報提供ネットワークへの接続に関する企画、連絡・調整等